Zwalczanie marchwi zarazy południowej Głęboko oraj lub niszcz chore rośliny. Należy pamiętać, że nawet podczas orki patogeny glebowe mogą jeszcze przetrwać i wywołać przyszłe epidemie. Pomocne może być uzupełnianie gleby nawozami organicznymi, kompostem i kontrolami biologicznymi kontrolować zarazę południową.